Aufgrund ähnlicher Übertragungswege liegt bei vielen HIV-Infizierten eine Doppelinfektion mit dem Hepatitis C Virus vor. Der Verlauf einer Hepatitis C bedingten Lebererkrankung ist bei Vorliegen einer HIV-Infektion beschleunigt (rascheres und häufigeres Auftreten von Leberzirrhose). Aus diesem Grunde muss bei Vorliegen einer HIV-Infektion immer auch untersucht werden, ob eine Infektion auch mit dem Hepatitis C Virus vorliegt. Die Diagnostik und eine mögliche medikamentöse Behandlung einer chronischen Hepatitis C bei ebenfalls vorliegender HIV-Infektion unterscheidet sich dann jedoch nicht von der Behandlung einer Hepatitis C Monoinfektion. Einzig muss unbedingt bei einer medikamentösen Behandlung auf mögliche Wechselwirkungen von Hepatitis C Medikamenten (DAA) mit den in der HIV-Therapie eingesetzten antiviralen Medikamenten geachtet werden. Dies setzt voraus, dass die behandelnde Praxis über dieses spezielle Wissen und nötige Erfahrung verfügt.